Det er flere hovedformer for proteinglyksosylering,
N-glykosylering der glykanet festes på aminosyren asparagin og O-glykosylering
der glykanet festes på aminosyrene treonin eller serin. Pasientene får som regel
symptomer fra flere organsystemer, nervesystemet er nesten alltid påvirket (det
finnes unntak). Alle andre organsystemer kan i prinsippet være affisert, blant
annet hjerte, lever, tarm, øye og skjelett. Det er svært stor variasjon i
alvorlighetsgrad og symptombilde. Medfødte glykosyleringsdefekter manifesterer
seg oftest i barndommen, men kan debutere i alle aldre. Ved medfødte, komplekse
utviklingsavvik bør det fortrinnsvis rekvireres genpanel for utviklingsavvik
med mindre det foreligger særskilt mistanke om glykosyleringsdefekt.
Før genpanelet rekvireres
må biokjemisk screening for medfødt metabolsk sykdom være utført, inkludert
kapillærelektroforese av serum transferrin (CDT) som er en screening for
N-glykosyleringsdefekter. Slik analyse utføres ved OUS-RH-MBK.
Ved
avvikende transferrinmønster kan
genpanelet rekvireres. Hos etnisk norske pasienter med type 1
transferrinmønster bør det først rekvireres analyse av PMM2. Ved negativ biokjemisk screening kan sterk klinisk mistanke
rettferdiggjøre rekvirering av genpanelet, og da spesielt siden
O-glykosyleringsdefektene ikke vil oppdages ved kapillærelektroforese av serum
transferrin.
Om genpanelet
Det utføres eksomsekvensering (alle kodende regioner inkludert spleiseseter), deretter bioinformatisk filtrering for å analysere genpanelet. Prøver av foreldre eller andre slektninger kan bli etterspurt til hjelp i tolkningsarbeidet. Svartid er omkring tre måneder, prøver kan prioriteres etter avtale. Genpanelet er basert på
- Jaeken J, Péanne R 2017 J Inherit Metab Dis 40:569
- Sparks SE et al; Congenital Disorders of N-Linked Glycosylation and Multiple Pathway Overview, sist oppdatert 12.01.17 og fritt tilgjengelig på www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1332/
- IEMbase (www.iembase.org)
Våre genpaneler oppdateres jevnlig, versjonsnummer angis i svarrapporten. Reanalyser utføres ikke rutinemessig, men kan rekvireres.
Begrensninger
Analysen påviser ikke kopitallsvarianter (duplikasjoner eller delesjoner større enn ca. 30 basepar), lavgradig mosaisisme, metyleringsavvik eller variasjon i repeterte sekvenselementer og homologe/dupliserte genomiske regioner.