Behandling er individuelt tilpasset, men her følger en generell beskrivelse av behandlingsforløpet.
Leppelukking
Leppelukking foregår ved 3-4 måneders alder. Barnet kommer på sykehuset dagen før operasjonen for å bli tilsett av kirurg og narkoselege. Man får informasjon om oppmøtetidspunkt dagen etter samt rutiner for fasting og annen forberedelse. Tiden på sykehus varierer fra 2-5 dager.
Ganelukking
Ganelukking foregår ved 1 års alder. Forberedelse er som ved leppelukking. Tiden på sykehus varierer fra 2-5 dager.
Beintransplantasjon
De barna som har spalte i kjevekammen må få gjort beintransplantasjon. Det er fordi tennene skal ha godt bein å bryte frem i. Det er kjeveortopedene som bestemmer tidspunktet for operasjonen, og det er tennenes frembrudd som avgjør når det ideelt sett skal gjøres. Forberedelsene til operasjon er som ved leppelukking. Tiden på sykehus er alt fra 0-4 dager.
Svelglappsoperasjon
Noen av barna har problemer med talen da luft lekker fra munnen og opp i nesen. Det kan da være aktuelt med svelglappsoperasjon, der en gjør åpningen fra munnen og opp i nesen mindre. Logoped i teamet avgjør om og når dette skal gjøres sammen med plastikkirurg.
Sekundær nese-leppekorreksjon
Ved 16 års alder gjør man en endelig vurdering av behandlingsresultatet. Da ser man både på funksjon og estetikk. Man planlegger da siste korreksjon som ofte dreier seg om nese-og leppekorreksjon.