Vi anbefaler at du alltid bruker siste versjon av nettleseren din.
logo Oslo universitetssykehus

Ekspertsykehuset - OUS sin blogg for fag, forskning og innovasjon

Vet du hva metabolomikk og lipidomikk er?

Global metabolomikk er undersøkelsen av de tusenvis av molekyler som inngår i alle kroppens biokjemiske prosesser. Betegnelsen «lipidomikk» brukes når vi utfører analysen for primært å fange opp de mest fettløselige metabolittene. Noen ganger gjør vi bare metabolomikk eller lipidomikk, og andre ganger gjør vi begge deler.

Katja Elgstøen, seksjonsleder, Seksjon for metabolomikk og lipidomikk og Helge Rootwelt, overlege ved Medisinsk faglig seksjon, Avdeling for medisinsk biokjemi, Klinikk for laboratoriemedisin (KLM), Oslo universitetssykehus (OUS).
Publisert 08.01.2025
Sist oppdatert 15.01.2025
En person som bruker en maskin

Foto: OUS

Seksjon for metabolomikk og lipidomikk ved Klinikk for laboratoriemedisin ble invitert av Springer Protocols, i Nature Publication Group, til å skrive hovedmetodekapittelet Global Metabolomics Using LC-MS for Clinical Applications i boken Clinical Metabolomics: Methods and Protocols.

Springer Protocols rager høyt, trolig aller høyest, på himmelen over metoder og prosedyrer som brukes i forskning og klinisk laboratoriemedisin, så dette er utvilsomt en stor fjær i hatten.

En kvinne som holder en bok

Foto: OUS

Katja Elgstøen, leder av kjernefasiliteten og Seksjon for metabolomikk og lipidomikk, med den rykende ferske boken Clinical Metabolomics: Methods and Protocols.

Vi er en liten gruppe, men anerkjent internasjonalt for høy kvalitet på vårt arbeid. Vi har en Kjernefasilitet for global metabolomikk og lipidomikk på Universitetet i Oslo og en Seksjon for metabolomikk og lipidomikk på Avdeling for medisinsk biokjemi ved Oslo universitetssykehus.

Vi tilbyr således tjenester både til forskere via kjernefasiliteten og til klinikere for diagnostikk. Forskningen er veletablert, mens de praktiske rutinene knyttet til rekvirering og rapportering av undersøkelse av metabolomet eller lipidomet for diagnostikk og persontilpasset medisin ennå er i støpeskjeen.

Undersøkelsen av molekyler

Det er ikke alle som vet hva metabolomikk og lipidomikk er, selv om vi har formidlet det aktivt de siste årene. 

Kort forklart er metabolomikk undersøkelsen av de tusenvis av molekyler som til enhver tid inngår i alle kroppens biokjemiske prosesser og som vi kan undersøke i en eneste dråpe blod, urin, spinalvæske, vevsekstrakt eller lignende.

Faktisk er også medisiner, kosttilskudd, næringsstoffer, stimulantia og så videre som vi inntar, samt viktige signalmolekyler, nedbrytningsprodukter og byggesteiner som lages av mikrobiomene våre, særlig i tarmen, en del av metabolomet vi kan påvise i én dråpe prøvemateriale.

Metabolomikkmetoden vår kan ikke fange opp alle disse molekylene, men vi ser faktisk de fleste og viktigste av dem.

En mann og en kvinne i et laboratorium

Foto: OUS

Barbora Pisklaskova og Ales Kvasnicka, metabolomikkeksperter fra Tsjekkia, fra Seksjon for metabolomikk.

Kan gi viktig informasjon

Mønsteret av metabolittene i en prøve kan gi viktig informasjon til diagnostikk og behandlingsvalg, og til å forutsi og følge sykdomsutviklingen. I tillegg kan vi påvise behandlingseffekt på biokjemisk nivå mye raskere enn man kan gjøre via kliniske endring, bildediagnostikk  eller på annet vis.

Metabolomikk fanger også opp om pasienten følger behandlingen som er avtalt, eller om medisinene ikke tas eller pasienten tar andre medikamenter eller tilskudd. Metabolomikken er på mange måter laboratoriemedisinens Sareptas krukke, en utømmelig kilde til viktig informasjon om pasientens helsestatus.

Middels bilde av kvinner iført hvite skjorter

Foto: OUS

Overlege Helge Rootwelt og seksjonsleder Katja Elgstøen inviterer engasjerte klinikere til samarbeid for å etablere bedre diagnostikk og persontilpasset behandling for utvalgte pasientgrupper.

Etablerer referansematerialer av metabolitter og metabolittprofiler

I laboratoriemedisin er det vanlig å sammenlikne resultatene fra en pasientprøve med et referansemateriale fra noen hundre friske normale kontroller (normalområdet).

Det å etablere referansematerialer for tusenvis av metabolitter er en krevende prosess. Matinntak og faste, grad av fysisk aktivitet og eventuelt ved sengeleie, samt tid på døgnet kan spille inn i betydelig grad. Dette arbeidet holder vi på med.

Vi ønsker også å etablere referansemetabolomer for ulike patologiske tilstander, det vil si sykdomsmetabolomer, med metabolittmønstre med diagnostiske og terapeutiske implikasjoner som kan underlette raskere og riktigere behandlingsvalg.

For eksempel jobber vi i SEPSOMICS-prosjektet med å finne mønstre som kan skille ulike stadier eller varianter av sepsis fra annen infeksjon eller organsvikt, og om sepsispasienter på sikt kan få persontilpasset immunmodulerende medisiner. 

Og så fikk vi for ikke lenge siden en veldig hyggelig respons fra administrerende direktør ved Oslo universitetssykehus, Bjørn Atle Lein Bjørnbeth, som med både toppsjefens og klinikerens hjerte og engasjement kommenterte:

- Tenk om dere også kan utvikle en metabolomikkanalyse for Akutt abdomen, som gjør at vi raskere og bedre kan finne ut hvem som trenger rask operasjon eller kun observasjon, om det er gastrokirurgi, gynekologi eller indremedisin - og om det er forsvarlig å la pasienten komme hjem,    

Oppfordrer klinikerne til tverrfaglig samarbeid

Jobber dere med pasientgrupper som dere skulle ønske dere hadde bedre verktøy til for å stille diagnose, velge behandling og følge behandlingsresponsen?

Ta kontakt med meg eller overlege Helge Rootwelt, så kan vi sammen samle pasientgrupper for å karakterisere deres metabolomer og etablere dette tilbudet.

Lenker:

Artikler:

Mer fra Ekspertsykehuset