Det er ansatt en daglig leder (barneonkolog) i 84 prosent stilling. I tillegg er det tilknyttet en administrativ stilling i p.t. 50 prosent. Kompetansetjenesten følger retningslinjer for nasjonale tjenester gitt av Helse- og Omsorgsdepartementet.

Kompetansetjenesen har en referansegruppe som gir råd om virksomhet og satsningsområder.

Det er dannet to faggrupper med medlemmer fra alle regioner, der alle aktuelle spesialistgrupper er representert.

• Faggruppen for svulster i sentralnervesystemet hos barn (CNS-faggruppen).
• Faggruppen for kreftsvulster hos barn (solide svulster utenfor CNS).

KSSB har et nært samarbeide med kreftregisteret om Nasjonalt kvalitetsregister for Barnekreft.  

Et nasjonalt patologi-snittarkiv er lokalisert til Patologiklinikken ved OUS Rikshospitalet, som har ansvaret for driften av arkivet.

KSSB har som kompetansetjeneste ikke behandlingsansvar for pasienter.