Effektiv behandling er viktig både for å bli kvitt symptomer, men også for å forebygge utvikling av arrvev og innsnevring av spiserøret. Behandlingsalternativene vi har i dag er eliminasjonsdiett og medisiner. Medisinene demper betennelsen, men behandler ikke selve sykdommen. For å oppnå en varig effekt, må du fjerne matvaren (allergenet) som fremprovoserer betennelsen.
Å finne fram til matvaren(e) som trigger betennelsen er utfordrende, og gjøres vanligvis ved en såkalt empirisk eliminasjonsdiett. Det innebærer at du tar de matvarene som vi fra før av vet at oftest forårsaker EoE, ut av kostholdet ditt. Allergiprøver (prikketest og blodprøve) har mindre nytte i EoE-behandling. Den eneste sikre måten å evaluere effekt av diett på, er ved ny gastroskopi. Når betennelsen er borte, kan du legge til én og én matvaregruppe i kostholdet ditt igjen, med kontroll-gastroskopier, helst etter hver reintroduksjon av en matvare.
Dersom du ikke oppnår noen effekt av dietten, eller ikke ønsker å prøve ut diett, er medisinsk behandling et alternativ. Den vanligste medisinske behandlingen er kortikosteroider (svelget astmamedisin) eller protonpumpehemmere, som virker både direkte mot betennelsen og demper syreproduksjonen i magesekken.