Diagnosen mistenkes ved typiske symptomer og bekreftes ved å gjøre en pH-registrering. Ved denne undersøkelsen føres et tynt rør føres fra nesen til spiserøret og registrere pH (hvor mye surt mageinnhold som renner tilbake til spiserøret) i løpet av et døgn.

Videre undersøkes barnet med røntgen av spiserør og magesekk. For noen pasienter er det også aktuelt å gjøre gastroskopi. Gastroskopi av barn gjøres i narkose. Legen fører en bøyelig slange med et kamera i enden ned i spiserør og magesekk slik at eventuelle syreforandringer i slimhinnen kan undersøkes. Hos noen vil man også undersøke om magesekken tømmer seg unormalt sakte (ventrikkelscintigrafi).

Hos de aller fleste barn kan sykdommen behandles med livsstilsendringer og medisiner. Barnet bør ligge med hevet overkropp og maten kan eventuell gjøres tykkere.  Barnet kan gis en medisin som legger seg som et "lokk" opp på maten og hindrer refluks. Hvis dette ikke er tilstrekkelig, vil barnet få medisiner som hemmer syreproduksjon.

Hos noen få barn er medisinsk behandling ikke tilstrekkelig for å fjerne symptomene og det vil være aktuelt med kirurgisk behandling. Man lager da en slags ventil som hindrer at mageinnhold renner tilbake til luftrøret.

Hos de fleste barn med GØR sykdom vil symptomene forsvinne i løpet av de første leveårene. Hos noen kan det være aktuelt med medisiner i flere år. Det er bare noen få av barna som behandles for GØR sykdom som vil trenge kirurgi.